乔丹就这样在纽约碰得焦头烂额。这个时候，他知道怎么让记者们闭嘴。他第一个举动是禁止记者采访，并且整个公牛队也皆拒绝会见记者。为此公牛队被NBA罚款25000美元。
NBA大区决战采用七战四胜制，先输两阵无需太悲观。面对困境仍然不慌不忙是杰克逊教练的优点，他说:“先想下一场比赛胜利，才能继续前进。”接下来的第三战在主场，公牛队的表现极佳，完全压倒尼克斯队，虽然乔丹的投射欠准，但是球队仍有100分以上的成绩，以103比83破了尼克斯队。当中以皮蓬的表现最令人注目。这一战是他们的转折点，他们重新拾回两连冠的自信。
第四战，一直投射失准的乔丹终于恢复状态，30球入18球，最后更取得54分之多，完全控制了比赛。公牛队以105比95获胜，将总比分扳平。双方同又回到一条起跑线上.
双方二比二打平之后，公牛队重回纽约作客的第五战是关键性赛事，因为公牛队如果要出线，最少要作客纽约时取得1场胜利，由于据过往历史的显示，战至第7仗的时候，主场球队会取得压倒性的优势，因此必须先胜第五战，然后再取之后主场第六战的胜利，这样就会避开第七场比赛。
第五战最后一连串的表现实在值得重温，当时公牛队以1分之微领先，尼克斯队十分小心，尤因和斯塔克斯采用挡拆战略，这时公牛队采用的措施就是不让斯塔克斯做掩护，使他走往相反方向的底线，退到底线的斯塔克斯只好把球回传给尤因，但被防守尤因的金所挡，球落到史密斯手上，史密斯在篮底尝试投篮，但这时乔丹已经补了过来，将球盖回到史密斯的手里，史密斯接球后又出手，这时皮蓬又跳起来将球盖掉，同样球又被史密斯捡到，接下来又被格兰特盖掉一次，史密斯总共出手了四次，都被盖掉。
最后篮球落在格兰特的手上，跟着立刻便传到乔丹手上，乔丹没有停球就再传给已经快速反击的阿姆斯特朗，而后者也不负所望投球擦板入篮，最终公牛队便以3分之微胜出此仗。
麦迪逊广场花园内一片死气沉沉，纽约球迷均认为尼克斯队可以得胜，因此十分泄气，到此时，不仅尼克斯队忘记了乔丹的大西洋城之行，连挑剔的记者们都开始纷纷转调、继续为飞人唱赞歌了。但乔丹依然不接受记者采访，似乎要将全部精力放在球场上。
第六战，虽然场地是芝加哥，但是并不轻松，乔丹这场比赛的投射再次失准，幸好有皮蓬，皮蓬的出色的表现完全可以填补乔丹，特别是第四节的重要时刻，最后一分钟时他的三分投射，便是全场具最决定性的一球，他成了公牛队在这轮赛事中胜出的最大功臣。乔丹的公牛队以96比88再度胜出，气走了本来不可一世的尼克斯队，也使莱利再一次领教到飞人的厉害。
NBA总决赛的对手是太阳队，感觉跟91年对湖人队的时候很相似，当年是魔术师对乔丹，而今年则是巴克利对乔丹，两次都是好友的对战。由于公牛和太阳两队都是出色的球队，因此战况相当白热化。
在以前，人们问乔丹，为什么你能和巴克利成为最要好的朋友?乔丹答道:“因为我们在场上的位置不同，这样我们就不需要互相盯防，所以我们才成为最好的朋友。”但这次两队交战，这两个好朋友之间就展开了一场真刀真枪的斗争。用乔丹的话来讲:“太阳队，他们只知道打比赛，但不知道怎样打赢比赛，这就是太阳和公牛的区别所在。”
虽然这次公牛队并不占有主场优势，赛前人们也不看好公牛队能夺冠，可乔丹却信心十足，在出发前的飞机上，杰克逊希望球员们至少能在太阳队的主场偷回一场胜利，可乔丹却说道:“为什么不是赢回两场呢?”
虽然太阳队中的得分主力是巴克利，可为巴克利提供支持的球员却是约翰逊，跟对付骑士队的普莱斯一样，杰克逊吩咐阿姆斯特朗要紧守约翰逊，由于约翰逊持球后的动作极快，只要半场一对一稍有空隙，便会被他摆脱。
阿姆斯特朗第一战的防守十分成功，约翰逊第一战13次出手，只命中4次，第二战8次出手，也只命中2次，而且第一战的助攻亦只有2次。客场比赛结束后，公牛队果然在客场取得两场胜利，胜利的天平已经倒向芝加哥这一边了。
在第三战时太阳队主教练在排兵步阵时有了变动，约翰逊的上场时间由前两场的平均32分钟增至第三场的全场赛事。在三度加时的63分钟内，除了最后1分钟外，约翰逊共上阵达62分钟，取得25分，9次助攻以及7个篮板。3度加时后，体力较佳的太阳队终于取回次胜利。