8月中旬，韦昌辉来到九江。
在太平天国中，韦昌辉的地位在西王萧朝贵之下，称北王六千岁。萧朝贵死后，韦昌辉地位窜升，仅在洪秀全、杨秀清之下。
韦昌辉原名韦正，韦家是广西桂平县金田村的大地主。太平军金田起义，便以韦家大宅为据点。韦昌辉倾尽家财，资助太平军起义，为太平军早期发展做出了突出贡献。
韦家子嗣甚盛，族人甚多。韦昌辉的北殿，在太平军诸山头中，势力仅次于杨秀清的东殿。北殿骨干中，国宗提督军务韦俊、大将张子朋等都是能征善战之将。
正如湘军《贼情汇纂》中形容的那样，韦昌辉“曾读书，小有才，为杨秀清所忌”。
太平军定都天京后，杨秀清提防韦昌辉最紧，一直把他留在天京，不让他出京带兵。
杨秀清一度重用天京本地人，酿成张继庚、叶芝发等多起叛变。不得已之下，杨秀清只得改令韦昌辉负责天京城防，开始放权给他。
石达开一回京，杨秀清就把城防大权转交给石达开，把韦昌辉晾到一边。
有一次，西征战事吃紧，杨秀清急令韦昌辉出京带兵。第二天，杨秀清便后悔起来，令属下上书，请留韦昌辉。杨秀清再顺势把韦昌辉召回京，其对韦昌辉的防范可见一斑。
韦昌辉阴险狡诈，对杨秀清极尽谄媚。北殿大将张子朋虐待湖南水营，激起水营哗变，杨秀清为此杖责韦昌辉数百。
当时，韦俊尚在前线带兵，听说后激愤交加，回京要找杨秀清算账。韦昌辉却以族长的身份斥责韦俊，不让他意气行事。
1855年，韦昌辉的亲哥哥与杨秀清的小舅子争夺房产，当街厮打起来。事情闹到杨秀清那里，杨秀清把两人交给韦昌辉发落。韦昌辉二话不说，将亲哥哥五马分尸。
旧时风俗，兄长如父。因韦昌辉才能杰出，才做了韦家的族长。但涉及家庭事务，仍应首尊兄长。韦昌辉被迫将大哥五马分尸，背后对杨秀清恨之入骨。
表面上，韦昌辉仍对杨秀清非常恭顺，恭顺得不像个北王六千岁。背地里，韦昌辉恨不得将杨秀清碎尸万段。
早在1855年上半年，湘军情报机关—营务处采编所就指出韦昌辉与杨秀清“其奸诈相似，阳下之而阴欲夺其权”，并预言“不久必有并吞之事”。
太平军大破清军江南江北两大营后，杨秀清志得意满，把杨辅清等亲信外放带兵，城内警卫力量减弱。
韦昌辉敏锐地觉察到：诛杀杨秀清的机会来了。他加紧串联秦日纲、石达开、陈承镕等在京重臣，得到洪秀全的默许。
杨秀清耳目甚多，也发现了韦昌辉的异样。他先发制人，严令韦昌辉、秦日纲、石达开三人限期出京，分往安徽、江苏、湖北督师，将一场叛乱消弥于无形。
韦昌辉被派往安徽督师。安徽本是石达开的势力范围，省会安庆还是西征军大本营。韦昌辉身为北王，却被杨秀清安排在翼殿根据地内督师，势必难有作为。
这正是杨秀清的小伎俩。他并不想让韦昌辉在战场上建功。同理，他把石达开派在湖北督师，湖北是北殿的势力范围，石达开同样难有作为。
然而，杨秀清此举看似聪明，却因此丢了小命。真是机关算尽太聪明，反误了卿卿性命！
因为韦昌辉在安徽督师，安徽离天京近，遇有急事，可以抢先回京。历史上，洪秀全密诏石达开、韦昌辉回京，诛杀杨秀清。
韦昌辉离天京近，首先得到密诏，率先进京。他有密诏在手，便拉秦日纲下水，让秦日纲担当天京事变的急先锋，顺利屠戮东王府。
韦昌辉本该在安徽安庆，他跑到江西九江干什么呢？
北殿在湖北攻城略地，韦昌辉又是北王六千岁，将在天京事变中扮演关键角色。吴捷不敢怠慢，亲自到九江城外迎接。
出人意料的是，韦昌辉行色匆匆，并不打算入城。他指挥随从为吴捷安排座位，和吴捷面对面坐下，开门见山地说道：
“贤弟，本王今天坐着中兴公司的汽轮，本想勘察安庆上游的防务。没想到，本王一时贪恋长江两岸的风光，不知不觉竟到了九江，来到了老弟的防区。
“想起来，本王曾在四年前路过九江。那时，贤弟刚刚从清妖手里夺占九江，保护大军东下进攻天京。本王有幸与贤弟一叙，始与贤弟攀上交情。
“谁能想到，贤弟后来镇守九江，才几年功夫，就把九江建得有声有色，比天京都要胜出不少。真是长江后浪推前浪，本王相信，贤弟劳苦功高，将来成就必在本王之上。”
1852年，太平军弃守武昌，全军东下争夺天京。当时，吴捷作为先锋，抢先夺占九江重镇。韦昌辉是后队统帅，最后路过九江。吴捷曾宴请韦昌辉等人，向韦昌辉示好。