后来发生了一件大事，依附于细川胜元的足利义元突然离开东军并逃到伊势国投靠北畠教具。
足利义元之所以离开的原因是担任足利义元和足利义仁的细川胜元倾向于废足利义元继承人的地位而立足利义尚为将军，没有履行把将军职位让位给足利义元的承诺。
足利义元在伊势国待了一段时间，后来在细川胜元和足利义仁的游说下返回东军，但又再次逃走到比睿山。
这给了西军一个机会，西军热烈欢迎被拥戴为“新将军”的足利义元，以与东军对抗，使得战斗更加复杂。
长期的战乱以与盗贼横行使京都市街地荒废，由于地方守护大名的介入使战线拉长，这导致东、西军的厌战气氛增大。
在李云天看来，这场东、西军之间的战斗意味着倭国旧势力的没落以及新兴势力的抬头，从镰仓时代后期开始，以名门武家、公家为首的旧势力不断被随生产力上升而壮大的国人、商人农民等取代已有权益。
由守护大名合议制组成的联合政权室町幕府中，除了三代将军足利义满以外，刚成立时将军的权力基础都十分脆弱，同时守护大名也自身难保，他们的权力渐渐受到守护代或有力家臣强大的影响。
这种称为下克上的效应不断在全国扩散，守护大名们转化为战国大名，日本的室町时代步入战乱期，迎来了倭国的战国时代，残存下来的庄园制度等旧制度开始迅速崩坏、持新的价值观的势力开始登场。
在那个时候由长子继承家督政权的体制因种种原因并未完全确立，这就是将军家守护大名家为了争夺家督而发生的“御家骚动”的原因。
以长子继承家督、在丰臣秀吉天下统一以后制度化、江戸幕藩体制中确立，在明治时代的旧民法法制化以及在战后的民法继续修正。
另外，这场东西军的大战也使得李云天趁机通过贸易从倭国获得了大量的白银等贵重物品，并且允许倭国的各守护大名借贷，这使得原本就贫瘠的倭国背上了沉重的外债。
很多人都不明白李云天为何要借钱给倭国，这钱要想拿回来可不容易，李云天肯定不会平白无故地这样做。
他之所以给那些守护大名提供资金，一是使得那些守护大名能发动更加猛烈的攻势，在战争中消耗倭国的兵力，二来也是使得倭国原本就不怎么好的经济雪上加霜，未来将不得不依靠大明的救助。
在李云天看来，如果能用金钱来消弱倭国军队的力量进而减少明军将士在战争中伤亡的话，很显然是一笔非常划算的买卖。
东、西军的这场大战中，除了九州岛和北海道岛部分地区外，倭国其他地区的大名皆卷入其中，双方的势力并没有明显的界限，犬牙交错地纠缠在一起。
像守护大名中的斯波家和畠山家，同宗兄弟分属东军和西军，为了各自的利益斗得不可开交。
九州岛和北海道岛由于距离倭国的京都太远，并且两个地方的大名历来与幕府的关系不怎么好，所以使得这两地的大名得以摆脱战争的漩涡。
说起来，九州岛之所以得名，是因为分为筑前、筑后、丰前、丰后、肥前、肥后、日向、萨摩和大隅九国，故而称为九州。
历史上，九州岛卷入这场东、西军大战的有两国，即筑前国与丰前国，这两国的守护大名是大内政弘。
大内政弘可是倭国举足轻重的，大内氏的第十四代家主，领有九州岛和筑前、丰前两国，以及本州岛的周防、长门两国全国，还有本州岛安芸国和石见国的一部分，实力强大，是西军的主力参战部队。
与别的守护大名不同，大内政弘的文化造诣精深，是倭国著名的文人。
值得一提的是，筑前、丰前和周防、长门是大内政弘在东、西军交战后夺取的领地，
在李云天看来，大内政弘是一个能文能武的全才，利用倭国的这场战争迅速扩张了领土，无疑是这场战争中当之无愧的赢家。
不过，大内政弘的运气有些差，他的领地正好与朝鲜隔对马岛相对，这意味着李云天将会以大内政弘的领地为突破口，打响此次东征大明的第一战。
按照李云天事先制定的计划，明军的东、西两路大军将在九州岛南、北同时登陆，然后以迅雷不及掩耳之势上下夹击九州岛上的守护大名，迅速扫除九州岛上的武装势力，进而集中力量应对来自本州岛和四国岛的倭军。