孙策伤势甚重，自知不久于人世，就请张昭等人，托以后事：“中原正在大乱之中，凭我们吴、越的兵众，三江的险固，足以观其虎斗成败。你们要好好辅佐我弟弟！”又招呼孙权，将印绶交予他，对他说：
“率领江东兵众，决战两阵之间，横行争衡天下，你不如我；但举贤任能，使其各尽其心，用以保守江东，我不如你。”到夜间孙策便去世了，时年二十六岁。孙权登基称帝后，追谥孙策为“长沙桓王”。为孙策立庙于建业朱雀桥南，后来派太子孙和前去亲祭。
兴平二年，孙策在周瑜、程普和黄盖等人的支持下，从历阳渡江，首先打败了牛渚营的刘繇，夺得仓库中所有粮食和兵器战具。当时，彭城相薛礼、下邳相笮融都依附刘繇，奉他为盟主，薛礼占据秣陵城，而笮融驻扎在秣陵县南。孙策首先攻打笮融，斩杀五万多人，笮融害怕，紧闭营门，不敢妄动。
孙策转而挥师攻打薛礼，薛礼突围逃走。这时樊能、于麋等人，又纠集兵士来夺牛渚。孙策立即回军，打败他们，俘获万余人。然后重新进攻笮融：战斗中，孙策腿部中箭，无法乘马，部下抬他回营疗伤。有人对笮融说：
“孙策被箭射死了！”笮融闻孙策死讯大喜，派将士与孙策部队对垒。孙策先派几百兵马挑战诱敌，而在后面设好伏兵。敌兵出击，孙策部假作溃败，引敌进入包围圈中，然后一声号令，伏兵尽起，斩杀一千多敌人。
孙策乘胜进攻笮融营地，并命手下将士高声喊话：“孙郎如何？”声撼敌营，地动山摇，吓得不少敌兵连夜奔逃。笮融见孙策还在，越发警惕小心，深沟高垒，严加守备。
孙策见笮融负险固守，一时难以攻克，便引兵南向，先在梅陵击败刘繇的别部，接着转兵攻克湖孰、江乘等地。然后整顿部队，到曲阿与刘繇决战。
刘繇与孙策交战，遭到惨败，逃往丹徒，孙策入据曲阿。孙策大军所到之处，军士们严遵将令，不掳掠百姓，鸡犬菜茹，秋毫无犯。于是，百姓十分喜悦，争着用牛、酒犒劳部队。孙策慰劳赏赐将士，派遣部下陈宝到阜陵迎接母亲和弟弟。又发布文告，告知下属各县：
“刘繇、笮融的乡人和部下来投降的，一概不多问其他；愿意从军的，可以从军，并免除全家赋税徭役；如果不愿从军，绝不勉强。”文告发布后，来归附者从四面八方赶来，不长时间，就招得士兵两万多，征得马匹一千多。自此，孙策之名威震江东。
建安元年，孙策继续进攻江东各地，吴郡人严白虎等各率有一万多人，驻扎严守各自的地盘。吴景等想先击破严白虎等，然后再到会稽。孙策说：“严白虎等群盗，心无大志，凭此就能将其擒获。”于是率兵渡过浙江，直逼会稽。
会稽功曹虞翻劝太守王朗暂避孙策的锋芒，王朗不听，发在固陵阻击孙策。
孙策几次发动进攻，均未能奏效。孙策的叔父孙静献策，建议声东击西，从查渎进兵，出其不意，攻其不备。
孙策依计。于夜里一面到处点燃火把，迷惑、牵制正面之敌，一面分出兵马悄悄从查渎出击。王朗出于意外，大惊，派周昕率兵仓猝迎战，孙策斩杀周昕，长驱直入。王朗败溃，带虞翻乘船逃到东冶。孙策派贺齐追击，王朗投降，于是会稽平定。