卡卡西的毒暂时解开了，但一时还不能动。大和想起3年前，甲、卡卡西、雪见3人在三岔路口分道扬镳的情景。大和也知道这是取走卡卡西写轮眼的好机会，但他没有那么做。
在卡卡西准备将甲押送回去的时候大蛇丸的实验体出现了，而为了救出甲的卡卡西中了大蛇丸的毒气，帮卡卡西解毒后甲决定放弃团藏的命令。
洞窟口外，根部乙一直埋伏在那里。大和从洞窟口出来，乙马上过来询问，“卡卡西呢？得手了吗？”大和道，“是的。”大和递给乙一个瓶子，瓶子里面的液体中有个眼睛。乙道，“没我出场的份了。尸体呢？”大和道，“我把现场伪装成了他中了大蛇丸陷阱的样子，应该会被火影暗部找到的。”乙并没有疑心，“很好，趁还没被发现，我们赶快回去吧！”大和看了一眼洞口，跟着乙直接往木叶方向去了。
卡卡西留在实验室里，过了好长时间才清醒过来，这才发现大和不见了。卡卡西看到了大和在墙壁上的留言，“我愈发不明白这个必须杀死同伴的任务究竟有何意义，所以我决定放弃任务。我会告诉团藏大人任务已经失败。请你自己保重！”落款是甲。
夕阳映红了天空，卡卡西全力赶回木叶，来到火影办公室门前，遇到了卯月夕颜。三代火影正在办公室书写信件，夕颜建议卡卡西先去疗伤，但卡卡西坚持先报告火影。猿飞听到了二人的话，让他们进来，“怎么了？”卡卡西道，“三代目，关于那个根部的木遁忍者……那家伙想杀我，应该是团藏大人的命令……但他违抗了命令，中途放弃任务救了我一命。估计返回村子了，不知道现在情况如何。”
醒来的卡卡西立即赶去报告三代，现在的甲正处于险境。卡卡西请求三代火影出面与团藏交涉，把甲救出来。猿飞拿起笔继续写字，卡卡西非常焦急，“三代目！”猿飞道，“照理说，连我都不能插手根的内部事务。但这次情况特殊……”
三代火影写好书信交给卯月夕颜，“带着这封信去根本部，就说是火影的命令！让团藏立刻来这里见我！”夕颜答应，三代道，“记住，如果团藏有恶意，你就报出月光疾风和金宇上忍的名字。拜托了，夕颜！”夕颜知道疾风是金宇的弟子，但不知道金宇与团藏的渊源，但还是道，“明白，请放心。”
夕颜离开后，猿飞让卡卡西去医疗班疗伤。但是卡卡西离开火影办公室后，却追上了夕颜，“我也去！”两个人如同两道箭影一样，飞速前进，奔向根的地下基地。
根部基地，团藏拿着瓶子怒不可遏，“这是怎么回事，甲？”大和道，“非常抱歉，任务失败了。”团藏道，“如果你们被卡卡西所杀，那么失败的是派你们去执行任务的我，因为我误算了卡卡西的实力。可现在你却用这种小花招欺骗乙，放弃任务恬不知耻地跑回来。你们明明可以两个人一起出手干掉卡卡西的。”团藏捏碎了瓶子，里面的眼珠变成了水母，那是大和的障眼法。甲乙二人俯首，不敢直视团藏。
团藏非常失望，“你到底想干什么？回答我，到底想干什么？”大和道，“卡卡西是木叶忍者，是木叶的同伴。杀害同伴的任务是正确的吗？”团藏道，“你的同伴只有同属根部的人。”大和道，“根难道不是木叶的同伴吗？”团藏道，“根是在看不见的地方支撑木叶这棵大树的组织，就像大树分为地上和地下两部分一样。根是独立存在的。乙，你告诉甲，什么是根部忍者。”
乙马上回答，“根的忍者没有姓名，没有感情，没有过去，没有未来，有的只是任务。”团藏咆哮，“而我身为根的首领，派出去的任务是绝对的！”大和却想起了雪见和实验室的那个同伴，团藏怒道，“你在听我说话吗，甲？”大和站起来，“不，我的名字不是甲！”团藏惊怒，“你说什么，你就是根的甲！除了这个代号以外，还能有什么？”大和满头大汗，“我是木叶的忍者，不只是根的。而是有树干有树枝的木叶忍者，根也一样，大家都是同伴。”
团藏很生气，“你被什么扰乱了心智？”团藏打开了右眼的写轮眼，用幻术放倒了大和。团藏命令乙，“把甲带到诊疗室，用更强的咒印束缚他！”乙答应。
正在这时，夕颜与卡卡西赶到了根部基地，“火影大人紧急召见团藏大人！”根部忍者丙和丁手持长戈拦住卡卡西二人，夕颜出示了火影的召唤状，“替我转告说火影大人要求团藏大人立刻过去！”根部丙回答，“团藏大人不在！等他回来我会传达这份召见命令的。”卡卡西道，“什么，现在他在哪里？”根部丁说不知道，“我们不可能猜测团藏大人的行动。”
团藏避而不见，卡卡西无奈，“夕颜，你先回去将消息告知三代大人。”夕颜道，“前辈你呢？”卡卡西道，“我在这里等他回来，你快去！”夕颜只好答应，转身离去。
团藏无视了三代召见的命令，卡卡西不得已侵入了根的基地。等夕颜离开根部基地后，卡卡西摘下暗部面具，硬闯丙和丁的关卡。丙和丁手持兵器拦阻，“前面是根部的领域！”卡卡西用写轮眼幻术放倒了丙。丁大惊，上前攻击卡卡西。卡卡西避开攻击，用写轮眼幻术将丁催眠，“甲在哪里？”丁中了幻术，说出了大和的下落。
房间内，团藏还在不满，“甲那家伙，卡卡西到底跟他说了些什么？”乙过来报告，“团藏大人，都准备好了。”团藏与乙一起走向诊疗室。